Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brpf1B2RRD7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Brpf1B2RRD7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms