Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ssxb8B1AY40 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ssxb8B1AY40 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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