Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc183A2AJB1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms