Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdfS4R2K0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdfS4R2K0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms