Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gria3Q9Z2W9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria3Q9Z2W9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria3Q9Z2W9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms