Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptgdr2Q9Z2J6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptgdr2Q9Z2J6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptgdr2Q9Z2J6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms