Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdpk1Q9Z2A0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdpk1Q9Z2A0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdpk1Q9Z2A0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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