Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RfxankQ9Z205 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RfxankQ9Z205 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RfxankQ9Z205 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms