Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trip6Q9Z1Y4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trip6Q9Z1Y4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trip6Q9Z1Y4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trip6Q9Z1Y4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms