Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VarsQ9Z1Q9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
VarsQ9Z1Q9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VarsQ9Z1Q9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms