Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cpne6Q9Z140 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cpne6Q9Z140 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cpne6Q9Z140 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cpne6Q9Z140 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms