Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo1Q9Z132 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rspo1Q9Z132 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rspo1Q9Z132 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.2 ms