Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr1h3Q9Z0Y9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr1h3Q9Z0Y9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nr1h3Q9Z0Y9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms