Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H3

Smarcb1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcb1Q9Z0H3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarcb1Q9Z0H3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcb1Q9Z0H3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcb1Q9Z0H3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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