Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ArcQ9WV31 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ArcQ9WV31 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ArcQ9WV31 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ArcQ9WV31 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms