Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp1a4Q9WV27 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1a4Q9WV27 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1a4Q9WV27 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms