Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim10Q9WUH5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim10Q9WUH5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim10Q9WUH5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms