Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpc2Q9R244 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trpc2Q9R244 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc2Q9R244 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms