Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfebQ9R210 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfebQ9R210 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfebQ9R210 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms