Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Abcc6Q9R1S7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Abcc6Q9R1S7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Abcc6Q9R1S7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Abcc6Q9R1S7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Abcc6Q9R1S7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Abcc6Q9R1S7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Abcc6Q9R1S7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms