Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psma1Q9R1P4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psma1Q9R1P4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psma1Q9R1P4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms