Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Slit2Q9R1B9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slit2Q9R1B9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit2Q9R1B9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Slit2Q9R1B9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms