Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ntn3Q9R1A3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ntn3Q9R1A3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ntn3Q9R1A3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms