Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrpxQ9R0M3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrpxQ9R0M3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpxQ9R0M3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms