Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nubp1Q9R060 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nubp1Q9R060 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nubp1Q9R060 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms