Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsjQ9R014 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CtsjQ9R014 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtsjQ9R014 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms