Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp11cQ9QZW0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp11cQ9QZW0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp11cQ9QZW0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms