Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf4Q9QZS2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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