Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp21Q9QZL6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp21Q9QZL6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp21Q9QZL6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp21Q9QZL6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms