Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Phtf1Q9QZ09 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Phtf1Q9QZ09 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phtf1Q9QZ09 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms