Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clic4Q9QYB1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clic4Q9QYB1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clic4Q9QYB1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clic4Q9QYB1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clic4Q9QYB1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clic4Q9QYB1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clic4Q9QYB1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clic4Q9QYB1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clic4Q9QYB1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms