Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdzd4Q9QY39 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd4Q9QY39 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd4Q9QY39 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd4Q9QY39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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