Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snai3Q9QY31 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snai3Q9QY31 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai3Q9QY31 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms