Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hacl1Q9QXE0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacl1Q9QXE0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacl1Q9QXE0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms