Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Limd1Q9QXD8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Limd1Q9QXD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Limd1Q9QXD8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms