Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer2Q9QWW1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer2Q9QWW1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Homer2Q9QWW1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Homer2Q9QWW1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms