Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LitafQ9JLJ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LitafQ9JLJ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LitafQ9JLJ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LitafQ9JLJ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LitafQ9JLJ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms