Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgm1Q9JLF6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm1Q9JLF6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm1Q9JLF6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms