Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prg3Q9JL95 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prg3Q9JL95 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prg3Q9JL95 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prg3Q9JL95 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms