Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rfx5Q9JL61 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx5Q9JL61 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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