Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccr10Q9JL21 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccr10Q9JL21 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccr10Q9JL21 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccr10Q9JL21 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccr10Q9JL21 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccr10Q9JL21 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccr10Q9JL21 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccr10Q9JL21 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccr10Q9JL21 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms