Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot9Q9JKY0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot9Q9JKY0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cnot9Q9JKY0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms