Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chrac1Q9JKP8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Chrac1Q9JKP8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Chrac1Q9JKP8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms