Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pard6bQ9JK83 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pard6bQ9JK83 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pard6bQ9JK83 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms