Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msgn1Q9JK54 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msgn1Q9JK54 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msgn1Q9JK54 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msgn1Q9JK54 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msgn1Q9JK54 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msgn1Q9JK54 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms