Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Caln1Q9JJG7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Caln1Q9JJG7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caln1Q9JJG7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms