Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Efcc1Q9JJF6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Efcc1Q9JJF6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms