Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riox1Q9JJF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riox1Q9JJF3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riox1Q9JJF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riox1Q9JJF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riox1Q9JJF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Riox1Q9JJF3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Riox1Q9JJF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riox1Q9JJF3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Riox1Q9JJF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms