Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ11

Tacc3, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacc3Q9JJ11 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Tacc3Q9JJ11 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Tacc3Q9JJ11 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tacc3Q9JJ11 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Tacc3Q9JJ11 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tacc3Q9JJ11 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tacc3Q9JJ11 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tacc3Q9JJ11 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Tacc3Q9JJ11 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Tacc3Q9JJ11 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Tacc3Q9JJ11 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tacc3Q9JJ11 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tacc3Q9JJ11 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tacc3Q9JJ11 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Tacc3Q9JJ11 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Tacc3Q9JJ11 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Tacc3Q9JJ11 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tacc3Q9JJ11 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Tacc3Q9JJ11 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms