Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHP7

Kdelc1, KDEL motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc1Q9JHP7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdelc1Q9JHP7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kdelc1Q9JHP7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdelc1Q9JHP7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms